Logo e bandiere.

Nel predisporre la carta intestata dell'Autorità Ambientale Regionale, i "loghi" si dispongono come le bandiere? Quindi quello della Regione a sinistra e quello dell'Autorità Ambientale a destra?

Sì, i loghi come le bandiere (anche se per quest'ultime vanno seguite regole particolari): se sono due, la più importante va a destra, quella meno importante va a sinistra. Perciò il logo della Regione a sinistra e quello dell'Autorità Ambientale a destra, però GUARDANDO IL FOGLIO (vale a dire che Regione è a destra e AA a sinistra).